透骨草形态极类似唇形科植物，如：叶对生；花冠唇形；雄蕊4，二强等。但其子房不4深裂，不成4小坚果而为瘦果，可区别于唇形科。其花部直立，开花后下垂也不同于唇形科。本科花形态近马鞭草科，但马鞭草科子房2-4室。